Les Rafale Marine au standard F2 (n°11, 12 et 13) ont été déployés, pour la première fois, à l'occasion de la mission du Charles de Gaulle en océan Indien. Le porte-avions avait quitté Toulon le 11 février 2007 pour assurer, de la mi-mars à fin avril, des opérations de soutien aérien au profit des troupes engagées sur le sol afghan contre les Talibans.
Le n°12 arbore les marques de trois largages de Bombe Guidées Laser (BGL), mission effectuée le 28 mars 2007 au dessus de l'Afghanistan.